大系与九个学院，三大系是指生物学、化学、地理地质学，九个学院是指数学与计算机、物理与电子学、信息技术、蒙古语言与文化、外国语言与文化、社会科学、国际关系、经济、法律。
自建校以来，蒙古国立大学培养出大批专业人才，约占全国知识分子的1/3。也就是说，在蒙古国内，每三个受过高等教育的学生中即有一人毕业于该校。这些高级知识分子活跃在国内各个领域，大多担任各种领导职务。
值得一提的是，国立大学的蒙古语言与文化学院、外国语言与文化学院，均开设了汉语专业，向学生教授汉语知识。同时，它还成功组建了国内最先进的汉语人才培训基地。该基地陆续培养出数百名汉语人才，其中有不少人已经成为国际知名学者或外交官。2007年，该校又与中国共同建起蒙古国立大学孔子学院，蒙孔学院不仅增进了中蒙两国人民的友谊，还推动了中蒙教育的深度交流。截至2015年，蒙古孔院已先后两次获评“全球先进孔子学院”。
从最初建校到如今的最高学府，蒙古国立大学经过了70多年的发展，现已成为国内唯一一座拥有上万名学生的现代化综合性大学。同时，它也是蒙古国社会科学、自然科学研究的重要中心之一。除了本国学生以外，该校每年都会吸引不少来自美国、俄罗斯、韩国、越南、中国、日本、阿富汗和土耳其等国的留学生前来学习交流。
1942年成立的蒙古国立大学是蒙古国最高学府，是最早建立的唯一的综合性大学，是社会科学、自然科学研究重要中心之一。